Protein–RNA interactions for Protein: P01863

Ighg, Ig gamma-2A chain C region, A allele, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghgP01863 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IghgP01863 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IghgP01863 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IghgP01863 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IghgP01863 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IghgP01863 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IghgP01863 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IghgP01863 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IghgP01863 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IghgP01863 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IghgP01863 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IghgP01863 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IghgP01863 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IghgP01863 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IghgP01863 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IghgP01863 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IghgP01863 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IghgP01863 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IghgP01863 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IghgP01863 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IghgP01863 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IghgP01863 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IghgP01863 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IghgP01863 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IghgP01863 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IghgP01863 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IghgP01863 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IghgP01863 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IghgP01863 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IghgP01863 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IghgP01863 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IghgP01863 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IghgP01863 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IghgP01863 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IghgP01863 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IghgP01863 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IghgP01863 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IghgP01863 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IghgP01863 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IghgP01863 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IghgP01863 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IghgP01863 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IghgP01863 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IghgP01863 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IghgP01863 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IghgP01863 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IghgP01863 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IghgP01863 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IghgP01863 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IghgP01863 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IghgP01863 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IghgP01863 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IghgP01863 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IghgP01863 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IghgP01863 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IghgP01863 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IghgP01863 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IghgP01863 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IghgP01863 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IghgP01863 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IghgP01863 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IghgP01863 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IghgP01863 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IghgP01863 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IghgP01863 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IghgP01863 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IghgP01863 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IghgP01863 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IghgP01863 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IghgP01863 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms