Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01853 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01853 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01853 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01853 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01853 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01853 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01853 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01853 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01853 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01853 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01853 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01853 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01853 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01853 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01853 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01853 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01853 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01853 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01853 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01853 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01853 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01853 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01853 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01853 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01853 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01853 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01853 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01853 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01853 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01853 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01853 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01853 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms