Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01791 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01791 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01791 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01791 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01791 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01791 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01791 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01791 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01791 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01791 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01791 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01791 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01791 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01791 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01791 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01791 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01791 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01791 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01791 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01791 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01791 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01791 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01791 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01791 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01791 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01791 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01791 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01791 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms