Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01757 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01757 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01757 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01757 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01757 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01757 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01757 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01757 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01757 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01757 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01757 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01757 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01757 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01757 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01757 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01757 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01757 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01757 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01757 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01757 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01757 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01757 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01757 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01757 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01757 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01757 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01757 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01757 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01757 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01757 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01757 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01757 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01757 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01757 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01757 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01757 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01757 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms