Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mtatp6P00848 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms