Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccl20O89093 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccl20O89093 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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