Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gnpda1O88958 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gnpda1O88958 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gnpda1O88958 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gnpda1O88958 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms