Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn3O88705 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn3O88705 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn3O88705 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn3O88705 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn3O88705 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn3O88705 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms