Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfrO88507 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CntfrO88507 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CntfrO88507 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CntfrO88507 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CntfrO88507 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CntfrO88507 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CntfrO88507 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms