Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dync1i1O88485 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dync1i1O88485 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dync1i1O88485 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dync1i1O88485 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms