Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkcO88445 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkcO88445 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkcO88445 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AurkcO88445 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AurkcO88445 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AurkcO88445 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AurkcO88445 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AurkcO88445 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AurkcO88445 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms