Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vti1bO88384 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vti1bO88384 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vti1bO88384 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vti1bO88384 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms