Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a2O55143 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a2O55143 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp2a2O55143 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms