Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr2O55101 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr2O55101 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syngr2O55101 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms