Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3O55013 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3O55013 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3O55013 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc3O55013 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc3O55013 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms