Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap6O54834 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap6O54834 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap6O54834 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap6O54834 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arhgap6O54834 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap6O54834 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap6O54834 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap6O54834 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap6O54834 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms