Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Per1O35973 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Per1O35973 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Per1O35973 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Per1O35973 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Per1O35973 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Per1O35973 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Per1O35973 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Per1O35973 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Per1O35973 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Per1O35973 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Per1O35973 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Per1O35973 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Per1O35973 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Per1O35973 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Per1O35973 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Per1O35973 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Per1O35973 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Per1O35973 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Per1O35973 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Per1O35973 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Per1O35973 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Per1O35973 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Per1O35973 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Per1O35973 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Per1O35973 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Per1O35973 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Per1O35973 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Per1O35973 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Per1O35973 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Per1O35973 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Per1O35973 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Per1O35973 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Per1O35973 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Per1O35973 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Per1O35973 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Per1O35973 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Per1O35973 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Per1O35973 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Per1O35973 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Per1O35973 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Per1O35973 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Per1O35973 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Per1O35973 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Per1O35973 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Per1O35973 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Per1O35973 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Per1O35973 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Per1O35973 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Per1O35973 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Per1O35973 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Per1O35973 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Per1O35973 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Per1O35973 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Per1O35973 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Per1O35973 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Per1O35973 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Per1O35973 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Per1O35973 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Per1O35973 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Per1O35973 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Per1O35973 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Per1O35973 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Per1O35973 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Per1O35973 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Per1O35973 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Per1O35973 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Per1O35973 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms