Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NudcO35685 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NudcO35685 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NudcO35685 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NudcO35685 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NudcO35685 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NudcO35685 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NudcO35685 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NudcO35685 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NudcO35685 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NudcO35685 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NudcO35685 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NudcO35685 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NudcO35685 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NudcO35685 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NudcO35685 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NudcO35685 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NudcO35685 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NudcO35685 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NudcO35685 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NudcO35685 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NudcO35685 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NudcO35685 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NudcO35685 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NudcO35685 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NudcO35685 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NudcO35685 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NudcO35685 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NudcO35685 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NudcO35685 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NudcO35685 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NudcO35685 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NudcO35685 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NudcO35685 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NudcO35685 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NudcO35685 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NudcO35685 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NudcO35685 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NudcO35685 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NudcO35685 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NudcO35685 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NudcO35685 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NudcO35685 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NudcO35685 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NudcO35685 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NudcO35685 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NudcO35685 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NudcO35685 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NudcO35685 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NudcO35685 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NudcO35685 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NudcO35685 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NudcO35685 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NudcO35685 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NudcO35685 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NudcO35685 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms