Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pold2O35654 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold2O35654 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pold2O35654 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pold2O35654 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pold2O35654 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pold2O35654 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pold2O35654 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold2O35654 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pold2O35654 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pold2O35654 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pold2O35654 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pold2O35654 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pold2O35654 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pold2O35654 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pold2O35654 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms