Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppt2O35448 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppt2O35448 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppt2O35448 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppt2O35448 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppt2O35448 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppt2O35448 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms