Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xbp1O35426 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xbp1O35426 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xbp1O35426 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms