Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snap23O09044 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snap23O09044 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snap23O09044 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snap23O09044 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snap23O09044 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snap23O09044 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snap23O09044 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snap23O09044 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snap23O09044 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap23O09044 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snap23O09044 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Snap23O09044 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Snap23O09044 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Snap23O09044 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap23O09044 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snap23O09044 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snap23O09044 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms