Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nfil3O08750 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nfil3O08750 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nfil3O08750 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfil3O08750 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms