Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn2O08529 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn2O08529 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn2O08529 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn2O08529 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn2O08529 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn2O08529 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn2O08529 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Capn2O08529 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn2O08529 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn2O08529 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn2O08529 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn2O08529 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn2O08529 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms