Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp35M0QWN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp35M0QWN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp35M0QWN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp35M0QWN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms