Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3424L7N298 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3424L7N298 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3424L7N298 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms