Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2035J3QP87 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2035J3QP87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms