Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21060J3KMU4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21060J3KMU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms