Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AK157302I3ITR1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AK157302I3ITR1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AK157302I3ITR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AK157302I3ITR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AK157302I3ITR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms