Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfip1G5E8V9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfip1G5E8V9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arfip1G5E8V9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfip1G5E8V9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms