Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r67G5E8C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r67G5E8C1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r67G5E8C1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms