Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vmn1r34G3XA52 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r34G3XA52 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r34G3XA52 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r34G3XA52 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r34G3XA52 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms