Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nccrp1G3X9C2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nccrp1G3X9C2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms