Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Farp1F8VPU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Farp1F8VPU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Farp1F8VPU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms