Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3371F7CQW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3371F7CQW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3371F7CQW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3371F7CQW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3371F7CQW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3371F7CQW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3371F7CQW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms