Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
3110082J24RikF6Z6Z2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
3110082J24RikF6Z6Z2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3110082J24RikF6Z6Z2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
3110082J24RikF6Z6Z2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms