Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Erich3F6QRE9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Erich3F6QRE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Erich3F6QRE9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Erich3F6QRE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Erich3F6QRE9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Erich3F6QRE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms