Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TrdnE9Q9K5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TrdnE9Q9K5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TrdnE9Q9K5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TrdnE9Q9K5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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