Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

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Length 4,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnah11E9Q7N9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnah11E9Q7N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnah11E9Q7N9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnah11E9Q7N9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dnah11E9Q7N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnah11E9Q7N9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnah11E9Q7N9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnah11E9Q7N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnah11E9Q7N9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms