Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf11E9Q6E5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf11E9Q6E5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srsf11E9Q6E5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf11E9Q6E5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms