Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc85cE9Q6B2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms