Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd2E9Q5F9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd2E9Q5F9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd2E9Q5F9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd2E9Q5F9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd2E9Q5F9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd2E9Q5F9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms