Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035044E0CXF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC035044E0CXF8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC035044E0CXF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BC035044E0CXF8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms