Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7H8

Cilp2, Cartilage intermediate layer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cilp2D3Z7H8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cilp2D3Z7H8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cilp2D3Z7H8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cilp2D3Z7H8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cilp2D3Z7H8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms