Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh8D3Z6W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh8D3Z6W3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh8D3Z6W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh8D3Z6W3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.7 ms