Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
3425401B19RikD3Z1D3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
3425401B19RikD3Z1D3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.78■■■■□ 3
3425401B19RikD3Z1D3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
3425401B19RikD3Z1D3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms