Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NuggcD3YWJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NuggcD3YWJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NuggcD3YWJ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NuggcD3YWJ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms