Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rexo5D3YW29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rexo5D3YW29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rexo5D3YW29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rexo5D3YW29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rexo5D3YW29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rexo5D3YW29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms