Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcb5B5X0E4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb5B5X0E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb5B5X0E4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb5B5X0E4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms