Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ppfia1B2RXQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia1B2RXQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ppfia1B2RXQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ppfia1B2RXQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms